肛管直肠周围脓肿的治疗，临床上分为内治、外治和手术治疗等法。祖国医学在内治、外治方面论述较详，对手术治疗也予肯定。

    实际上肛门直肠周围脓肿形成和发展的过程，一般要经过肛门隐窝炎伴有肛旁或粘膜部的组织炎、肛门直肠周围脓肿、脓肿破溃或排脓后形成肛瘘的三个阶段。肛周脓肿初期，采用中药清热解毒或选用西药青霉素、庆大霉素等；或同时使用中西药物栓剂；外洗坐浴药物等，以防止便秘，保持大便通畅，大多数肛隐窝炎经及时治疗都可治愈。少数患者因肛门腺感染、化脓。并向肛门周围间隙或粘膜下蔓延，可形成脓肿，故应及时手术切开排脓。术中应尽量准确地找到原发内口，根据脓肿位置和括约肌的关系，采用切开或切开挂线根治术一次治疗。一般不要采用分期治疗(如先排脓，以后治肛瘘)、这对减轻患者痛苦和避免二次手术带来的肛门功能损害很有意义。对于深部脓肿也不应等待硬结变软，出现波动，才行手术，以致延迟切开排脓，一旦明确诊断就必须进行手术治疗。